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数据分析可以防止未来流行病期间的测试瓶颈

突破性研究表明，临床实验室在疫情最严重期间采用了两种基于数据分析的策略来满足COVID-19检测需求。这些发现发表在美国临床化学协会(AACC)的数据科学期刊上。应用检验医学杂志，为实验室提供了一个使用数据分析的蓝图，以确保患者在未来传染病爆发期间获得检测。

在大流行的头两年，实验室面临的一个重大挑战是在长期供应短缺的情况下满足检测需求。虽然目前这还不是一个严重的问题，因为美国的COVID-19病例相对较低，但实验室再次解决这个问题只是时间问题——要么是因为一种新的变异导致的COVID-19病例激增，要么是因为一种新的传染病完全爆发。

耶鲁大学医学院Rohit B. Sangal医学博士、MBA、FACEP领导的一个研究小组表明，实验室可以使用电子病历系统确保在大流行期间优化分配稀缺的检测资源。

查看完整的研究https://academic.oup.com/jalm/article/8/1/98/6848829．

在2021年12月至2022年1月的组粒变异激增期间，Sangal的卫生保健系统制定了指导方针，以确保对适当的患者使用有限的SARS-CoV-2检测以及SARS-CoV-2、流感和呼吸道合胞病毒(RSV)的联合检测。为了帮助临床医生在订购测试时遵守这些指导方针，Sangal的团队于2021年12月22日重新设计了EHR的测试订购界面。

在此之后，Sangal的团队分析了重新设计前三周和重新设计后三周的测试订单数据，发现重新设计的EHR成功地改变了测试模式，使其与指导方针保持一致。对于从急诊科出院的有症状患者，COVID-19 +流感/RSV检测减少了49%，而COVID-19 +流感检测增加了160%。同时，对于入院的有症状患者，COVID-19 +流感/RSV检测增加了128%。这不仅意味着合适的病人得到了合适的测试，而且这些变化每周节省了大约437个测试盒，从而保留了有限的测试资源供应。

Sangal说:“在供应链限制的情况下，简单的电子病历重新设计与加强对SARS-CoV-2和流感检测机构指南的遵守有关，因此需要对稀缺的检测资源进行优化配置。”“随着可用资源的不断变化，临床医生的教育是不够的。相反，在现有工作流程中嵌入基于系统的干预措施可以更好地协调资源，满足社区的测试需求。”

这些发现建立在大流行开始时由加拿大温哥华圣保罗医院的Daniel T. Holmes医学博士领导的数据分析工作的基础上，该工作展示了实验室如何使用数据自动化来处理与疫情相关的检测激增。

查看完整的研究https://academic.oup.com/jalm/article/8/1/41/6840464．

在大流行的第一年，SARS-CoV-2检测仪器的供应短缺开始影响圣保罗医院满足检测需求的能力。作为回应，Holmes的团队使用开源软件工具(Linux、bash、R、RShiny、ShinyProxy和Docker)开发了一个自动化的工作流程，以管理和优化SARS-CoV-2测试过程的所有步骤。从2020年9月到12月，这种自动化工作流程将实验室用于SARS-CoV-2检测的试剂消耗减少了约58%。

在他小组的论文中应用检验医学杂志Holmes说:“我们描述了我们的数据自动化策略，用于SARS-CoV-2的单例和合并样本[测试]，并扩展到其他病毒PCR[聚合酶链反应]分析。说明了所使用的开源软件工具以及软件开发和操作部署策略。这项工作将为读者提供在需要时如何开发和部署类似工具的指导。”

- - - - - -来源:协会的