研究:数据共享是癌症研究的关键

美国癌症研究中心的研究人员领导的一项研究表明,一种促进癌症中心之间数据和生物标本共享的新系统可能会加快癌症研究成果从实验室到患者护理的速度匹兹堡大学医学院.这项研究发表在12月15日的《科学》杂志上癌症研究是美国癌症研究协会的期刊。

的研究人员UPMC CancerCenter和它的合作伙伴匹兹堡大学癌症研究所美国佐治亚摄政大学癌症中心、罗斯威尔公园癌症研究所和宾夕法尼亚大学艾布拉姆森癌症中心共同开发了TIES癌症研究网络(TCRN)。研究人员提出,TCRN是一个使用先进的医学报告文本处理的联合网络,是促进所有癌症中心转化研究的有用模型。随着对个性化治疗和精准医疗需求的增长,开发更复杂的系统来促进数据甚至组织样本的跨中心共享是必不可少的。

“有了TCRN,我们可以更有效地研究罕见疾病和常见疾病的罕见行为。研究人员可能在一个机构没有足够的案例来支持一项引人注目的研究,但他们现在可以汇总和访问多个机构的数据和生物材料,”首席研究员丽贝卡雅各布森说,她是皮特医学院生物医学信息学教授,也是个性化医学研究所的首席信息官。

传统上,来自不同机构的癌症研究人员通过集中的网络进行合作,其中一个机构接受所有相关数据和材料,并将其提供给其他机构。每个单独的研究都需要自己的技术基础设施和协议来运行。作为替代方案,研究人员着手创建一个基础设施,可以用于许多机构的许多研究,而无需移动任何数据。

“集中式模式无法扩展到全国网络。雅各布森说:“每一项新的研究或新的机构都意味着中央数据经纪人要做更多的工作,而机构不想放弃管理自己数据的权力。”“这种新的网络模型提供了技术、法律协议和标准,可以方便地跨机构使用去识别数据和组织标本。你可以把它想象成数据和生物材料共享的高速公路,帮助研究人员更快地到达那里。”

Jacobson的团队先前开发了文本信息提取系统(TIES),这是一种最先进的语言处理系统,作为TCRN的基础技术。

资料来源:匹兹堡大学医学中心